More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2393 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4112  primosome assembly protein PriA  49.44 
 
 		 739 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3946  primosome assembly protein PriA  50.49 
 
 		 738 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1010  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 725 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0758  primosome assembly protein PriA  50.07 
 
 		 725 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1804  primosome assembly protein PriA  47.9 
 
 		 744 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.207657  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1737  primosome assembly protein PriA  47.9 
 
 		 744 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2583  primosome assembly protein PriA  49.59 
 
 		 744 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0427  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 738 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2927  primosome assembly protein PriA  49.43 
 
 		 734 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1322  primosome assembly protein PriA  49.86 
 
 		 725 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0108  primosome assembly protein PriA  47.91 
 
 		 745 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0270  primosome assembly protein PriA  48.87 
 
 		 735 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2393  primosome assembly protein PriA  100 
 
 		 733 aa  1466    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0179  primosome assembly protein PriA  48.88 
 
 		 734 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2053  primosome assembly protein PriA  51.61 
 
 		 727 aa  680    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.785816  normal  0.492845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  50.14 
 
 		 730 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0554  primosome assembly protein PriA  48.73 
 
 		 735 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.348137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0535  primosome assembly protein PriA  49.09 
 
 		 738 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1926  primosome assembly protein PriA  49.93 
 
 		 727 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0448061  hitchhiker  0.000000000544837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2378  primosome assembly protein PriA  47.23 
 
 		 735 aa  637    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2279  primosome assembly protein PriA  64.36 
 
 		 722 aa  909    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3657  primosome assembly protein PriA  50.21 
 
 		 738 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3213  primosome assembly protein PriA  51.58 
 
 		 726 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0603  primosome assembly protein PriA  50.76 
 
 		 759 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.615341  normal  0.0181016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0218  primosome assembly protein PriA  66.57 
 
 		 734 aa  964    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0402  primosome assembly protein PriA  49.79 
 
 		 736 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  54.79 
 
 		 731 aa  782    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0176  primosome assembly protein PriA  48.51 
 
 		 736 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0840  primosome assembly protein PriA  51.32 
 
 		 729 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00727054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1100  primosome assembly protein PriA  48.1 
 
 		 740 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1033  primosome assembly protein PriA  47.32 
 
 		 732 aa  632  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1614  primosome assembly protein PriA  50 
 
 		 754 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1225  primosome assembly protein PriA  49.3 
 
 		 730 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0560  primosome assembly protein PriA  49.02 
 
 		 730 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.926963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2212  primosome assembly protein PriA  49.02 
 
 		 730 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0538  primosome assembly protein PriA  48.07 
 
 		 736 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1222  primosome assembly protein PriA  47.76 
 
 		 811 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2498  primosome assembly protein PriA  47.1 
 
 		 733 aa  607  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.430233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2807  primosome assembly protein PriA  46.12 
 
 		 727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0240  primosome assembly protein PriA  47.89 
 
 		 724 aa  595  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1677  primosome assembly protein PriA  50.77 
 
 		 718 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.915582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  39.51 
 
 		 738 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0483  primosomal protein N'  33.76 
 
 		 658 aa  474  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.522146  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1200  primosomal protein N  41.19 
 
 		 780 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  39.19 
 
 		 758 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0544  primosomal protein n  41.28 
 
 		 658 aa  456  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  37.1 
 
 		 752 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  36.47 
 
 		 752 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  37.98 
 
 		 754 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5787  primosome assembly protein PriA  38.96 
 
 		 739 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2743  primosome assembly protein PriA  35.64 
 
 		 733 aa  438  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  40.17 
 
 		 804 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66720  primosome assembly protein PriA  38.85 
 
 		 739 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  37.91 
 
 		 801 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001745  helicase PriA essential for oriC/DnaA-independent DNA replication  35.16 
 
 		 733 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  37.75 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  37.74 
 
 		 801 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0206  primosomal protein N'  35.8 
 
 		 709 aa  430  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0536  primosome assembly protein PriA  37.48 
 
 		 743 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2496  primosome assembly protein PriA  42 
 
 		 738 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.733405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5088  primosome assembly protein PriA  37.26 
 
 		 739 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0028  primosome assembly protein PriA  35.62 
 
 		 736 aa  428  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5138  primosome assembly protein PriA  37.36 
 
 		 739 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4961  primosome assembly protein PriA  37.09 
 
 		 739 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  34.31 
 
 		 732 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  37.56 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  36.39 
 
 		 801 aa  426  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0743  primosomal protein N'  38.47 
 
 		 720 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000000905593  unclonable  0.000000000088889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.09 
 
 		 732 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0591  primosomal protein N`  38.47 
 
 		 720 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.798479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  36.99 
 
 		 801 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  38.57 
 
 		 803 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0377  primosome assembly protein PriA  37.25 
 
 		 746 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00727  primosome assembly protein PriA  35.03 
 
 		 733 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  39.55 
 
 		 801 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2251  primosome assembly protein PriA  35.67 
 
 		 734 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  36.51 
 
 		 746 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  37.22 
 
 		 801 aa  422  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  38.36 
 
 		 744 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  43.25 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2594  primosomal protein N`  38.15 
 
 		 733 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1987  primosomal protein N' (replication factor Y)  35.29 
 
 		 774 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  34.17 
 
 		 809 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  37.1 
 
 		 781 aa  419  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  36.93 
 
 		 798 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0275  primosomal protein N'  40.83 
 
 		 737 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00025836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3173  primosome assembly protein PriA  37.8 
 
 		 765 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0398  primosome assembly protein PriA  36.73 
 
 		 739 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4038  primosome assembly protein PriA  36.08 
 
 		 731 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0400  primosome assembly protein PriA  36.69 
 
 		 744 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  36.01 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0799  primosomal protein N'  37.94 
 
 		 774 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  34.19 
 
 		 747 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1123  primosome assembly protein PriA  34.12 
 
 		 730 aa  412  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0274294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3497  primosome assembly protein PriA  37.87 
 
 		 765 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.631062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>