More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2314 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  100 
 
 
375 aa  764    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  81.07 
 
 
375 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  76.27 
 
 
375 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  64.8 
 
 
375 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  63.47 
 
 
375 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  62.03 
 
 
376 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  61.7 
 
 
376 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  65.16 
 
 
376 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 
376 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  60.86 
 
 
376 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  64.24 
 
 
344 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2982  peptide chain release factor 2  67.29 
 
 
321 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186364  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3208  peptide chain release factor 2  67.29 
 
 
321 aa  448  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.760596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3166  peptide chain release factor 2  67.6 
 
 
321 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2977  peptide chain release factor 2  59.95 
 
 
375 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  61.52 
 
 
367 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  66.36 
 
 
321 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1623  peptide chain release factor 2  59.95 
 
 
375 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622299  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  65.42 
 
 
321 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  58.58 
 
 
375 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5077  peptide chain release factor 2  68.54 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30933  normal  0.0341665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  66.77 
 
 
322 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1856  peptide chain release factor 2  59.13 
 
 
375 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  58.58 
 
 
402 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  65.66 
 
 
342 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  58.74 
 
 
376 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  64.6 
 
 
322 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  56.68 
 
 
374 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  65.27 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  57.22 
 
 
375 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  64.74 
 
 
322 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  55.8 
 
 
379 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  53.72 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  55.1 
 
 
391 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  60.9 
 
 
322 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  53.17 
 
 
459 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  60.58 
 
 
323 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  53.44 
 
 
367 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  53.96 
 
 
357 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  53.76 
 
 
367 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  53.37 
 
 
357 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  54.81 
 
 
391 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  54.81 
 
 
391 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  54.52 
 
 
406 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  54.81 
 
 
391 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  53.26 
 
 
367 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52 
 
 
372 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  53.47 
 
 
367 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  55.16 
 
 
364 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1299  peptide chain release factor 2  64.47 
 
 
321 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0921443  normal  0.567483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  53.54 
 
 
417 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 
365 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  52.77 
 
 
365 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 
365 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  60.9 
 
 
322 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 
365 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3006  peptide chain release factor 2  61.8 
 
 
322 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.743846  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.39 
 
 
365 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  52.62 
 
 
365 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2445  peptide chain release factor 2  60.25 
 
 
322 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.689282  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  52.77 
 
 
365 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  51.31 
 
 
359 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  51.56 
 
 
364 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 
364 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  52.33 
 
 
365 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  52.03 
 
 
365 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  51.45 
 
 
365 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2851  peptide chain release factor 2  59.01 
 
 
322 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205155  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  58.65 
 
 
322 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 
382 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  52.48 
 
 
365 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  52.51 
 
 
349 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 
349 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  53.06 
 
 
349 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  52.19 
 
 
354 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  51.02 
 
 
349 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  52.51 
 
 
349 aa  371  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  51.92 
 
 
369 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  52.33 
 
 
365 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  51.27 
 
 
364 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.97 
 
 
371 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  52.89 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  52.2 
 
 
378 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  49.47 
 
 
372 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  52.71 
 
 
374 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  51.34 
 
 
365 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  53.29 
 
 
331 aa  362  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  54.55 
 
 
366 aa  363  4e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
355 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  52.13 
 
 
329 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 
364 aa  361  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  50.86 
 
 
367 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  51.79 
 
 
367 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  50.86 
 
 
367 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  52.98 
 
 
325 aa  359  4e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  51.07 
 
 
332 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  53.07 
 
 
325 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0705  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  48.72 
 
 
366 aa  358  6e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0302  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  53.8 
 
 
365 aa  358  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>