More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2259 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  58.84 
 
 
297 aa  320  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.39 
 
 
292 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  53.05 
 
 
298 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  52.68 
 
 
298 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  49.56 
 
 
296 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  54.63 
 
 
226 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 
294 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  51.64 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  51.17 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  53.27 
 
 
297 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  51.89 
 
 
298 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  53.24 
 
 
297 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
241 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
297 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.53 
 
 
297 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 
295 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  49.06 
 
 
289 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  48.6 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  48.36 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  50.71 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  49.07 
 
 
299 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  51.64 
 
 
297 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
291 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48 
 
 
291 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
291 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  48.44 
 
 
291 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 
281 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
309 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  43.2 
 
 
292 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  47.91 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 
325 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  43.8 
 
 
291 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  44.69 
 
 
296 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
296 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  42.11 
 
 
296 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  47.83 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  48.83 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  46.01 
 
 
296 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  47.89 
 
 
295 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 
264 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.14 
 
 
241 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.2 
 
 
398 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  39.37 
 
 
357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  45.24 
 
 
325 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  47.37 
 
 
326 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  47.37 
 
 
326 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  46.19 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 
326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  48.08 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  47.12 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 
275 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  45.97 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  43.97 
 
 
330 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  47.12 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
235 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
326 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  47.89 
 
 
325 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  46.15 
 
 
330 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  43.61 
 
 
279 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.75 
 
 
432 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
326 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
326 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  43.53 
 
 
330 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  43 
 
 
284 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.66 
 
 
302 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 
429 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
325 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 
335 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  43.12 
 
 
326 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  39.68 
 
 
435 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.36 
 
 
410 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 
403 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.21 
 
 
237 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  43.69 
 
 
281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  41.23 
 
 
279 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  44.34 
 
 
411 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 
240 aa  156  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 
237 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
328 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  43.96 
 
 
398 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 
322 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  43.2 
 
 
281 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  45.28 
 
 
419 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>