More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2211 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  100 
 
 		 423 aa  866    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  32.29 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  34.79 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  33.92 
 
 		 413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  33.42 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  30.49 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  31.44 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  34.04 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  31.67 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  30.41 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  30.93 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.02 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 444 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  30.71 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  30.33 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  29.93 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  30.17 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  29.68 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.39 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.19 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  30.22 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  30.03 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.97 
 
 		 413 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.31 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.5 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  25.73 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  28.5 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  28.68 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.25 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.36 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 422 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  29.43 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  27.38 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  27.38 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  25.9 
 
 		 403 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  28.68 
 
 		 422 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.1 
 
 		 418 aa  107  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.98 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  28.19 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.72 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27.49 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  27.51 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  27.97 
 
 		 419 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  26.08 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  28.4 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  26.1 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.12 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000983731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  27.46 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  26.33 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.32 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.89 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 393 aa  96.7  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  26.49 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  26.02 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.61 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  23.49 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  24.83 
 
 		 440 aa  94  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.04 
 
 		 461 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.35 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  27.67 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  25.46 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.24 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  24.76 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  28.53 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  24.55 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  26.48 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  27.53 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  24.76 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  25.9 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  26.07 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.88 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.48 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  26 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.25 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.05 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  25.43 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.49 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  23.63 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  26.51 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.41 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>