More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2097 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2097  general substrate transporter  100 
 
 		 424 aa  834    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00320357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0669  general substrate transporter  40.95 
 
 		 438 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.543796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2247  General substrate transporter  42.03 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.286148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  44.85 
 
 		 443 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1033  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 473 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2290  general substrate transporter  41.3 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.931887  normal  0.162976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2565  General substrate transporter  41.3 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0129523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1266  major facilitator family transporter  40.64 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1404  major facilitator family transporter  40.64 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1258  major facilitator family transporter  40.64 
 
 		 485 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 443 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 443 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1100  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0383  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0766  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1862  major facilitator family transporter  40.39 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 440 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4720  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5468  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350259  normal  0.0257067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0950  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  40.05 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  40.29 
 
 		 434 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  37.71 
 
 		 431 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5898  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0212784 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  39.81 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55220  MFS family transporter  42.96 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.872465  hitchhiker  0.00000012197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  37.38 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4765  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.210768 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5518  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.85791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  41.69 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3602  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 426 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0204  major facilitator family transporter  38.8 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.289201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  36.92 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  39.12 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  37.59 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.91 
 
 		 437 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  39.47 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  39.71 
 
 		 445 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4101  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 443 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.66 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2584  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 433 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2710  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.72 
 
 		 438 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  36.19 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4548  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5756  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0626076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  37.62 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4434  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6531  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1297  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0389845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  37.5 
 
 		 439 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  38.06 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  36.43 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  36.43 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3972  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  36.43 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  36.43 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  36.43 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3820  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 441 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 442 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.05 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  40.34 
 
 		 427 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  36.94 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  37.05 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  37.35 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 433 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 535 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 440 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 436 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>