More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2072 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  100 
 
 		 325 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  61.42 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1454  protein translocase subunit secF  47.96 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3037  protein-export membrane protein SecF  41.69 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.94 
 
 		 856 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  41.48 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0457  preprotein translocase subunit SecF  44.88 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0172615  normal  0.0827508 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  39.42 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  41.69 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.78 
 
 		 853 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3171  preprotein translocase subunit SecF  43.28 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  42.22 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  43.23 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  41.64 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.94 
 
 		 848 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  39.74 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  41.16 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  38.8 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.05 
 
 		 846 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  41.25 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  40 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.27 
 
 		 849 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  43.75 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  43.75 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.08 
 
 		 839 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4405  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0338927  normal  0.256135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.28 
 
 		 856 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1768  preprotein translocase subunit SecF  41.2 
 
 		 352 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148605  normal  0.0118701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.8 
 
 		 844 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.62 
 
 		 846 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1800  preprotein translocase subunit SecF  41.43 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0690803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1858  preprotein translocase subunit SecF  44.22 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150957  normal  0.772867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  41.53 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.99 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.46 
 
 		 845 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  37.46 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.59 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.06 
 
 		 844 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.51 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  36.69 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  37 
 
 		 315 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  36.16 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  38.26 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4227  protein-export membrane protein SecF  36.51 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.25 
 
 		 834 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  34.67 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2189  protein-export membrane protein SecF  35.97 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4746  protein-export membrane protein SecF  36.09 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0265427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  36.09 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  36.09 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  38.16 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  34.67 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4597  protein-export membrane protein SecF  36.51 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.106389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  40.91 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.87 
 
 		 844 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  36.27 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  37.79 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1107  preprotein translocase subunit SecF  37.38 
 
 		 414 aa  203  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  38.26 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2492  protein-export membrane protein SecF  35.31 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27994  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  37.83 
 
 		 303 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  37.75 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  42.86 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1278  preprotein translocase subunit SecF  37.05 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000278006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  35.92 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4643  preprotein translocase subunit SecF  33.44 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  36.54 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  35.92 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  36.54 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  36.54 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  36.54 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  35.71 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.73 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  38 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  32.03 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  34.3 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  36.01 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  33.33 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  37.79 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.23 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2947  preprotein translocase subunit SecF  33 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  34.73 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  34.8 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>