More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2058 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  48.02 
 
 
226 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  48.23 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  44.72 
 
 
222 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  41.46 
 
 
224 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
246 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.08 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
227 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 
193 aa  87.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.44 
 
 
244 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.12 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.12 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.12 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.12 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.12 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.04 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.61 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  26.24 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  31 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.59 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.64 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  29 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  26.19 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.85 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  25.35 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  28.29 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  31.22 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  26.37 
 
 
182 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 
186 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  21.24 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
187 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.45 
 
 
533 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  25.87 
 
 
188 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
258 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  26.6 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4084  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  26.13 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  25.23 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4196  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.52 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  28.49 
 
 
200 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>