23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2051 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1546    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  52.75 
 
 		 770 aa  700    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  50.19 
 
 		 774 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  38.93 
 
 		 818 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  33.06 
 
 		 825 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  32.05 
 
 		 816 aa  336  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  31.24 
 
 		 830 aa  317  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  39.52 
 
 		 828 aa  269  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  27.92 
 
 		 926 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  28.82 
 
 		 1137 aa  154  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  29.37 
 
 		 1171 aa  147  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  25.04 
 
 		 1107 aa  141  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.6 
 
 		 818 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  25.63 
 
 		 1056 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  28.12 
 
 		 954 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  26.87 
 
 		 978 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  28.54 
 
 		 818 aa  84.7  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.64 
 
 		 1320 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  25.3 
 
 		 1383 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  33.91 
 
 		 1153 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  34.51 
 
 		 1101 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1142 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>