More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2032 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  72.41 
 
 		 429 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  73.19 
 
 		 435 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  72.73 
 
 		 429 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  67.13 
 
 		 431 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  73.19 
 
 		 430 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  66.9 
 
 		 429 aa  634    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  69.46 
 
 		 430 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  70.79 
 
 		 446 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  81.88 
 
 		 427 aa  746    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  72.73 
 
 		 429 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  68.22 
 
 		 433 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  73.35 
 
 		 436 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  71.33 
 
 		 429 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  73.66 
 
 		 429 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  69.28 
 
 		 433 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  100 
 
 		 428 aa  895    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1841  citrate synthase  71.16 
 
 		 430 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.040491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  71.33 
 
 		 430 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  68.78 
 
 		 434 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  72.26 
 
 		 430 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  71.69 
 
 		 431 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  86.21 
 
 		 427 aa  781    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  74.65 
 
 		 438 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  71.79 
 
 		 429 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  72.96 
 
 		 429 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  70.56 
 
 		 429 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  67.53 
 
 		 425 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  73.07 
 
 		 434 aa  669    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  72.03 
 
 		 430 aa  670    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  69.23 
 
 		 428 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  70.79 
 
 		 429 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  69.54 
 
 		 431 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  73.19 
 
 		 429 aa  674    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  69.7 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  69.01 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  66.67 
 
 		 429 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  67.99 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  67.99 
 
 		 434 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  67.21 
 
 		 433 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  67.85 
 
 		 432 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  67.67 
 
 		 433 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  69.93 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  69.93 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  69.25 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  70.28 
 
 		 430 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  631  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  70.16 
 
 		 428 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  70.16 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  69.46 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  67.21 
 
 		 433 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  69.07 
 
 		 429 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  70.16 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  69.01 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  68.76 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  70.16 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  67.21 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  70.14 
 
 		 436 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  67.76 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  70.16 
 
 		 428 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  628  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  69.7 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  69 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  68.07 
 
 		 428 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  69.46 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  68.84 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  68.84 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  67.13 
 
 		 428 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  68.84 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  69.23 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2919  type II citrate synthase  67.6 
 
 		 428 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  68.84 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  66.9 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  66.51 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  66.67 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  67.61 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  68.2 
 
 		 436 aa  624  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2189  type II citrate synthase  67.6 
 
 		 445 aa  624  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00268971  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1806  citrate synthase  69.81 
 
 		 430 aa  626  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0810  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  66.28 
 
 		 433 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  66.98 
 
 		 433 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  69.27 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  68.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>