149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2000 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 327 aa  649    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0160  aminoglycoside phosphotransferase  56.11 
 
 		 323 aa  318  9e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.549928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  55.9 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  45.54 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  46.23 
 
 		 360 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2843  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  43.43 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0083  aminoglycoside phosphotransferase  41.05 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.972168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0493  aminoglycoside phosphotransferase  39.48 
 
 		 514 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3435  aminoglycoside phosphotransferase  41.88 
 
 		 332 aa  188  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1606  protein of unknown function UPF0079  39.32 
 
 		 529 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0383764  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0054  hypothetical protein  38.37 
 
 		 507 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.885213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2954  aminoglycoside phosphotransferase  42.47 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.290607  normal  0.0281748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 384 aa  175  8e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0046  hypothetical protein  36.34 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.810658  normal  0.280558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  35.94 
 
 		 505 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  35.76 
 
 		 506 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  36.86 
 
 		 549 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  35.34 
 
 		 506 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  36.1 
 
 		 523 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0175  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00583599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4850  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  38.96 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1523  hypothetical protein  44.11 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  36.36 
 
 		 540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  36.81 
 
 		 542 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4542  hypothetical protein  37.75 
 
 		 529 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  38.36 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0086  hypothetical protein  34.2 
 
 		 509 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  38.19 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2100  hypothetical protein  36.28 
 
 		 513 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  33.15 
 
 		 562 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0135  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  37.54 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  35.8 
 
 		 523 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  36.22 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0206  hypothetical protein  35.06 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0259343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2017  hypothetical protein  35.99 
 
 		 513 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  37.03 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  37.17 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  33.13 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  34.31 
 
 		 504 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  35.16 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0820  hypothetical protein  36.73 
 
 		 509 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  34.38 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  38.85 
 
 		 331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  35.22 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  37.46 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  36.27 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  33.22 
 
 		 379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0051  hypothetical protein  33.72 
 
 		 502 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  31.61 
 
 		 379 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  36.42 
 
 		 346 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3578  hypothetical protein  35.42 
 
 		 498 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.303943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4289  protein of unknown function UPF0079  31.69 
 
 		 505 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0623599  normal  0.680884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  35.37 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  33.54 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  33.86 
 
 		 365 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  37.38 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 		 387 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  35.58 
 
 		 393 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  32.52 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  37.82 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  36.58 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  37.88 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3962  protein of unknown function UPF0079  32.07 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  37.07 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  35.18 
 
 		 345 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  31.94 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  31.75 
 
 		 497 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  32.1 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 		 361 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  36.13 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  30.51 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  36.46 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  32.99 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>