27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1970 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  43.53 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  36.21 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  36.21 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  35.88 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  37.68 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  39.13 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  36.92 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  31.9 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  28.1 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  34.51 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  31.03 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  36.11 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  29.57 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  33.67 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  33.67 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  40.32 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  34.72 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  30 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  30.38 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  27.12 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>