161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1847 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1847  aspartate racemase  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.20632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1380  aspartate racemase  58.08 
 
 		 232 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0021  aspartate racemase  39.47 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0941  aspartate racemase  38.43 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2728  hypothetical protein  38.43 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.881231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0550  aspartate racemase  39.3 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112794  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0199  aspartate racemase  40.26 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3727  aspartate racemase  40.43 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4503  aspartate racemase  41.85 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1412  aspartate racemase  36.28 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1908  aspartate racemase  40.71 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1412  aspartate racemase family protein  37.12 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193401  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0370  aspartate racemase family protein  37.12 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000827408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1521  aspartate racemase  37.12 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00121722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2048  aspartate racemase  35.53 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00935047  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5934  aspartate racemase  39.21 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2143  aspartate racemase  39.21 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2007  aspartate racemase  36.4 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2251  aspartate racemase family protein  36.4 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85155e-27 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03998  aspartate racemase  38.5 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2335  aspartate racemase family protein  36 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.209175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1530  aspartate racemase  36.09 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.204202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4072  aspartate racemase  38.63 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  0.78132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2253  aspartate racemase family protein  36.4 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.159416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2067  aspartate racemase family protein  35.53 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2223  aspartate racemase family protein  35.53 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2886  hypothetical protein  37.27 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1127  aspartate racemase  38.33 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  0.372995 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2006  aspartate racemase  35.96 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.975999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1262  aspartate racemase  36.4 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.399281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2161  aspartate racemase  37.89 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.779512  normal  0.822901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2599  aspartate racemase  35.06 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577714  normal  0.0780411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3685  aspartate racemase  37.17 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3160  aspartate racemase  36.84 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000632506  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02688  predicted racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0080  aspartate racemase, putative  32.73 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2180  aspartate racemase  37.39 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4108  putative racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000397336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2987  putative racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3160  putative racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02649  hypothetical protein  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0875  putative racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3023  putative racemase  35.81 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2977  aspartate racemase  37.99 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2205  aspartate racemase family protein  36.16 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0120  aspartate racemase, putative  32.27 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2987  putative racemase  36.24 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0674464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4055  aspartate racemase  38.05 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2053  aspartate racemase  37.44 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3120  aspartate racemase family protein  35.71 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.755099  hitchhiker  0.0000148082 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0850  aspartate racemase  35.81 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1062  aspartate racemase  37.5 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0092  putative aspartate racemase  32.27 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1970  aspartate racemase  38.26 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1171  aspartate racemase  37.99 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000110091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5449  aspartate racemase  37.89 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1375  aspartate racemase  38.43 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2506  aspartate racemase  37.55 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000098  aspartate racemase  34.67 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.220289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4364  aspartate racemase  41.23 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3053  aspartate racemase  40.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1897  aspartate racemase  36.89 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2760  aspartate racemase  36.68 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458115  normal  0.682156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4593  aspartate racemase  36.68 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243748  normal  0.631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3286  putative racemase  34.93 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.989342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1249  aspartate racemase  35.81 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4003  aspartate racemase  35.5 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000429712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0902  aspartate racemase  38.79 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4559  aspartate racemase  34.78 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.110424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0918  aspartate racemase  35.06 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.468864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0972  aspartate racemase  37.55 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0005  aspartate racemase  36.68 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1147  aspartate racemase  36.96 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0351  aspartate racemase  39.74 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2098  aspartate racemase  34.05 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.817779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1157  aspartate racemase  34.89 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0053  aspartate racemase  29.87 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0734  aspartate racemase  32.29 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000319838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1082  aspartate racemase  36.68 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2199  aspartate/glutamate racemase family protein  34.22 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3409  aspartate racemase  37.27 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2793  aspartate racemase  34.09 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0185  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1877  aspartate racemase  32.74 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2706  aspartate racemase family protein  30.97 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2665  aspartate racemase family protein  30.53 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2383  aspartate racemase  30.53 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2497  aspartate racemase  31.44 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2661  aspartate racemase family protein  30.53 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.561952  hitchhiker  0.0000201094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2422  aspartate racemase  30.09 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00910723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2663  aspartate racemase family protein  30.53 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2787  aspartate racemase  36.52 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3231  putative racemase  33.19 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000134766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2459  aspartate racemase family protein  30.09 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2639  aspartate racemase family protein  30.09 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3165  putative racemase  33.19 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3347  putative racemase  33.19 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.042763 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3183  putative racemase  33.19 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3246  putative racemase  33.19 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000445722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2656  aspartate racemase family protein  29.65 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000254701 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>