92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1795 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  55.75 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  64.91 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  60.87 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  52.89 
 
 		 386 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  51.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  54.1 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  61.61 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  55.12 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  49.56 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  52.89 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  48.82 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  50.4 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  61.4 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  59.22 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  57.78 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  48.67 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  52.5 
 
 		 386 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  51.52 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  50.45 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  46.55 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  58.51 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  41.67 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  49.49 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  40.71 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  35.14 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  45.78 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  45.79 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  64.62 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  48.18 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3301  hypothetical protein  51.3 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  60.76 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2654  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  45.98 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  46.73 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.284202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  41.25 
 
 		 89 aa  67  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  41.76 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  39.36 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  38.3 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  41.03 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  41.03 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  47.83 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  40.23 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  46.97 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0363  hypothetical protein  40.54 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.029871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  36.14 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  47.46 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  36.05 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  36.05 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  36.05 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  43.08 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  41.67 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  42.42 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  41.54 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  31.11 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  42.19 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  34.07 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  34.09 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  34.09 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  47.54 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  31.65 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  51.72 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  44 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  36.76 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  45.83 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  34.41 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  53.12 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  28.95 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  60.71 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  76 
 
 		 138 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  27.78 
 
 		 114 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  27.5 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  45.24 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  52.78 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  57.14 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  36.26 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  27.63 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  36.78 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  51.61 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  32.73 
 
 		 122 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  33.8 
 
 		 160 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>