More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1510 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1510  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.963665  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  50.91 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  47.27 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  44.84 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.24 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  43.95 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  43.5 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  47.3 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  41.44 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  43.05 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.29 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  45.25 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  44.59 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  42.34 
 
 		 231 aa  167  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 231 aa  167  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 247 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.44 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  38.64 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6795  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.73 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  42.34 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  40.36 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  40.36 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  41.18 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6334  two-component regulatory system response regulator  46.61 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.36 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.91 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 243 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>