255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1506 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1506  transposase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  95.8 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  95.8 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  95.8 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  71.74 
 
 		 231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  70.43 
 
 		 232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  67.83 
 
 		 231 aa  324  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  82.1 
 
 		 162 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  82.48 
 
 		 166 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  44.05 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  43.4 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  42.13 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  45.25 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  43.75 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  45.25 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  45.25 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  42.86 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  43.35 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  43.61 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  44.05 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  70.91 
 
 		 110 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  43.16 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  39.3 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  43.61 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  47.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  47.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  47.57 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  47.09 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  46.6 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  45.85 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  50.28 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  42.01 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  42.01 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  42.01 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  42.01 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  42.01 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  42.15 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  48.7 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  42.15 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  42.15 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  42.15 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  42.08 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  42.08 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  39.82 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  37.77 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  38.5 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  84.62 
 
 		 81 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  35.82 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  35.64 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  35.84 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  39.66 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  35.26 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  35.26 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  35 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  33.68 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  33.98 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  35 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  33.5 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  33.66 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  33.98 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  33.51 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  35.29 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  32.99 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  33.72 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.71 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  33.14 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.12 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.71 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  30.3 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  34.12 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  32.82 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  35.52 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  31.05 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  31.05 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  31.05 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  35.45 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  34.65 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  35.08 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  33.15 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  31.98 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  33.88 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  32.02 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  35.15 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  30.81 
 
 		 224 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  31.4 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  31.4 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  31.4 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  31.13 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  34.63 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  34.63 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  29 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  34.3 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>