258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1481 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1481  transposase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  100 
 
 
238 aa  491  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  95.8 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  70.87 
 
 
231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  69.57 
 
 
232 aa  336  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  66.96 
 
 
231 aa  323  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  82.1 
 
 
162 aa  279  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  82.48 
 
 
166 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  45.66 
 
 
243 aa  184  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  43.53 
 
 
238 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  43.84 
 
 
238 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  45.25 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  44.39 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  45.25 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  45.25 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  44.44 
 
 
238 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  45.25 
 
 
237 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  45.66 
 
 
238 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  44.05 
 
 
238 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  70.91 
 
 
110 aa  164  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  45.21 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  43.69 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  39.81 
 
 
236 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  47.57 
 
 
233 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  47.57 
 
 
233 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  47.57 
 
 
233 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  47.09 
 
 
233 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  46.6 
 
 
233 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  45.85 
 
 
233 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  42.47 
 
 
233 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  42.47 
 
 
233 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  42.47 
 
 
233 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  42.47 
 
 
233 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  42.47 
 
 
233 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  52.66 
 
 
180 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  42.79 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  42.79 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  42.79 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  42.79 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  49.22 
 
 
232 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  42.34 
 
 
242 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  42.73 
 
 
242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  38.79 
 
 
237 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  40.27 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  39.35 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  87.69 
 
 
81 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  36.06 
 
 
236 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  40.23 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  36.36 
 
 
237 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  34.36 
 
 
235 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.97 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  33 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  33.98 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  35.1 
 
 
236 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  33.65 
 
 
235 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  34.43 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  34.43 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  34.13 
 
 
224 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  34.48 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  33.33 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  32.97 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  33.85 
 
 
222 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  35.6 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  31.47 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  30.77 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  31.79 
 
 
226 aa  109  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.71 
 
 
243 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  32.42 
 
 
226 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  33.33 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  32.78 
 
 
226 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  35.98 
 
 
213 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  30.26 
 
 
226 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  30.26 
 
 
226 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  30.26 
 
 
226 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  34.76 
 
 
236 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  35.98 
 
 
212 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  32.18 
 
 
214 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  33.15 
 
 
263 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  32.78 
 
 
226 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  34.07 
 
 
238 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  31.03 
 
 
224 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  31.61 
 
 
224 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  29.7 
 
 
221 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  31.61 
 
 
224 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  29.7 
 
 
221 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 
224 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  32.7 
 
 
246 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  32.14 
 
 
302 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  31.61 
 
 
224 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  35.47 
 
 
254 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  35.47 
 
 
254 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  32.14 
 
 
235 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  35.47 
 
 
264 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>