More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1436 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  885    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0703  hypothetical protein  75 
 
 		 420 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  75 
 
 		 402 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  59.64 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  57.66 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  58.72 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  56.93 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  59.06 
 
 		 403 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  57.43 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  57.91 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  61.27 
 
 		 390 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  57.25 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  56.56 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  56.52 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  55.2 
 
 		 392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  56.51 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  58.1 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  54.95 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  54.95 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  57.11 
 
 		 428 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  58.9 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  58.81 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  55.22 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  58.4 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  56.23 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  54.22 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  54.98 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  55.42 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  56.07 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  54.73 
 
 		 411 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  57.14 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  55.67 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  57.83 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  55.61 
 
 		 425 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  55.36 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  55.36 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  54.95 
 
 		 431 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  53.69 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1362  radical SAM protein  54.17 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  53.42 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  51.04 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  51.14 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  46.04 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  46.93 
 
 		 356 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  47.18 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  48.9 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  44.86 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  44.42 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  43.04 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  43.04 
 
 		 381 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  43.04 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  43.54 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  47.54 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  43.6 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  45.87 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  43.29 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  47.57 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  45.87 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  47.66 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  42.53 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  43.62 
 
 		 382 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  43.75 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  47.34 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  44.62 
 
 		 369 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1592  hypothetical protein  48.16 
 
 		 383 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2543  radical SAM enzyme, Cfr family  48.44 
 
 		 383 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  hitchhiker  0.00648935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.76 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47 
 
 		 384 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.58 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.33 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.58 
 
 		 373 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.3 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  45.43 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  47.07 
 
 		 359 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.3 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.71 
 
 		 373 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.3 
 
 		 398 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  45.67 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.08 
 
 		 373 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.74 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  46.09 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  47.03 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  47.03 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  47.34 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  47.03 
 
 		 379 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.58 
 
 		 388 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  45.43 
 
 		 382 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>