More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1373 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  68.44 
 
 
228 aa  321  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  58.85 
 
 
254 aa  261  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  54.32 
 
 
257 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.17 
 
 
248 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  57.08 
 
 
247 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  56.19 
 
 
247 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.81 
 
 
251 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  52.65 
 
 
255 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.98 
 
 
248 aa  245  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.95 
 
 
255 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.39 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.39 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.1 
 
 
252 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.1 
 
 
257 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.45 
 
 
252 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  52.86 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  52.86 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
249 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.42 
 
 
244 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  54.43 
 
 
267 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  52.21 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  50.46 
 
 
228 aa  234  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.22 
 
 
237 aa  235  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.65 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.65 
 
 
252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.21 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  56.11 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.42 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  47.73 
 
 
227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.84 
 
 
261 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
266 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  53.74 
 
 
259 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
252 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
240 aa  230  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.34 
 
 
257 aa  230  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.3 
 
 
259 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
253 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  52.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  52.61 
 
 
253 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
252 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
253 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
253 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
253 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.37 
 
 
252 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
246 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  52.21 
 
 
266 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.23 
 
 
256 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
246 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
256 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.91 
 
 
267 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  51.33 
 
 
294 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
251 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
256 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.56 
 
 
249 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
253 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.1 
 
 
245 aa  225  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  224  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.33 
 
 
251 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
251 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
254 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  49.77 
 
 
248 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
261 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
248 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.11 
 
 
249 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
253 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
253 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.23 
 
 
249 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.89 
 
 
249 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
249 aa  222  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
257 aa  222  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.15 
 
 
256 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.88 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 
252 aa  221  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
246 aa  221  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
251 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
251 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  51.33 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.17 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  51.33 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1450  undecaprenyl diphosphate synthase  48.28 
 
 
255 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.207922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
243 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>