More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1353 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  100 
 
 		 337 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  73 
 
 		 337 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  70.03 
 
 		 341 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  55.73 
 
 		 335 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  55.62 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  56.13 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  53.17 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  54.83 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  54.49 
 
 		 336 aa  348  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2950  farnesyltranstransferase  57.85 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  53.33 
 
 		 336 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  54.21 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  54.01 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  55.32 
 
 		 345 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  52.42 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  54.71 
 
 		 345 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  52.42 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  52.23 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  53.89 
 
 		 336 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  54.01 
 
 		 340 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  54.01 
 
 		 340 aa  341  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  52.31 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  52.82 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  54.15 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  51.84 
 
 		 356 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  51.71 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  51.69 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  48.8 
 
 		 338 aa  328  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0943  octaprenyl-diphosphate synthase  52.15 
 
 		 338 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.560813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0458  polyprenyl synthetase  50.92 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.480075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  51.91 
 
 		 336 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0567  Farnesyltranstransferase  52.65 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  52.2 
 
 		 333 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  52.2 
 
 		 333 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0523  Polyprenyl synthetase  51.71 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057969  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2184  trans-hexaprenyltranstransferase  52.31 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  52.52 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  47.13 
 
 		 331 aa  309  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  52.52 
 
 		 333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  56.12 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  48.78 
 
 		 335 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  50.66 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  48.42 
 
 		 345 aa  288  6e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  48.54 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  46.96 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  46.3 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  48.45 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  43.99 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  49.51 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  44.58 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45.91 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  43.67 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  46.23 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  46.54 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  45.68 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  48.28 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  45.68 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  45.68 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  45.51 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  47.1 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  46.5 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  46.18 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  46.65 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  46.13 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  46.6 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  45.31 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  43.22 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  45.17 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  45.08 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  46.02 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  46.65 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  45.48 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  48.16 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  47.42 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  47.56 
 
 		 337 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  49.33 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  46.63 
 
 		 325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  48.12 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  46.01 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  43.49 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  46.27 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  46.44 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  45.31 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  46.01 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  44.75 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  45.91 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  48.09 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  45.69 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  42.59 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 		 323 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  41.96 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>