66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1352 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  68.54 
 
 		 111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  70.11 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  70.45 
 
 		 95 aa  130  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  66.67 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  68.97 
 
 		 106 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  66.67 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  66.67 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  67.78 
 
 		 94 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  68.97 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  68.6 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  70.59 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  68.67 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  64.77 
 
 		 103 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  68.67 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  64.37 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  62.22 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  61.8 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  63.53 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  60.67 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  63.41 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  61.36 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  58.82 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  60 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  60 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  64.77 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  59.76 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  59.09 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  61.73 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  64.77 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  60.71 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  52.63 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  52.33 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  48.72 
 
 		 141 aa  83.6  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  45.45 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  42.17 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38.96 
 
 		 384 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  34.07 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.06 
 
 		 375 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  36.59 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  28.75 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.91 
 
 		 393 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.06 
 
 		 377 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  35.06 
 
 		 375 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  33.33 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 		 379 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  32.1 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 		 375 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.17 
 
 		 383 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  36.84 
 
 		 379 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.59 
 
 		 384 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  32 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  26.51 
 
 		 399 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  31.82 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.38 
 
 		 371 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.18 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  33.87 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  28.75 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  26.32 
 
 		 391 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  31.4 
 
 		 475 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0661  Chorismate mutase  40.48 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  37.5 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  32.84 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  27.63 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>