More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1351 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 158 aa  239  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  73.51 
 
 		 157 aa  236  5.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 161 aa  225  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 166 aa  222  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 166 aa  217  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 166 aa  214  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  67.32 
 
 		 166 aa  213  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 164 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 166 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 166 aa  213  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 170 aa  180  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 159 aa  177  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  56.58 
 
 		 160 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  56 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  52.03 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  52.03 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  51.7 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  51.02 
 
 		 175 aa  153  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  49.67 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 181 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  45.1 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  44.67 
 
 		 152 aa  140  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  45.33 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  45.33 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  45.33 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  45.33 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.52 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 229 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.67 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  41.18 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>