More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1269 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  73.19 
 
 		 455 aa  680    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 455 aa  913    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  72.19 
 
 		 457 aa  664    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  57.58 
 
 		 443 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  59.34 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  59.34 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  59.34 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  58.68 
 
 		 446 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  57.4 
 
 		 447 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  55.82 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  56.04 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  56.92 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  55.6 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  57.14 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  57.14 
 
 		 446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  58.02 
 
 		 446 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  57.96 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  57.36 
 
 		 443 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  56.14 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  57.96 
 
 		 447 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  57.8 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  57.74 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  57.74 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  57.14 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  56.04 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  56.14 
 
 		 442 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  54.51 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  55.6 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  54.51 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  57.58 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  55.41 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  54.95 
 
 		 443 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  55.83 
 
 		 449 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  51.97 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  52.18 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  52.63 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  51.88 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  51.32 
 
 		 452 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.34 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  49.56 
 
 		 453 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  51.1 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  50.92 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  50.81 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  50.92 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  50.55 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  50.56 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  51.13 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  50.46 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  50.46 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  52.05 
 
 		 454 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  49.43 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  49.43 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  50.93 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50.65 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  51.16 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  48.51 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  50.46 
 
 		 446 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 		 446 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  48.61 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  48.61 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  48.61 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0621  preprotein translocase, SecY subunit  50.34 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  47.92 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  49.44 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  47.69 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  47.72 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  49.54 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0343  preprotein translocase subunit SecY  51.15 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0602  preprotein translocase subunit SecY  50.69 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129742  normal  0.608925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3894  preprotein translocase subunit SecY  50.69 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000749966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  50.35 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0514  preprotein translocase subunit SecY  48.76 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.27475  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0453  preprotein translocase subunit SecY  48.31 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.124481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0425  preprotein translocase subunit SecY  51.15 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0303  preprotein translocase subunit SecY  50.69 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000136571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0413  preprotein translocase, SecY subunit  50.46 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000043612  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3616  preprotein translocase subunit SecY  50.46 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00028758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>