More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1261 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  82.81 
 
 		 192 aa  332  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  78.24 
 
 		 193 aa  317  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  73.33 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  68.68 
 
 		 188 aa  275  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  68.68 
 
 		 188 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  71.11 
 
 		 197 aa  271  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  67.57 
 
 		 188 aa  270  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  67.22 
 
 		 185 aa  267  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  68 
 
 		 180 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  65.95 
 
 		 188 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  68.39 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  64.86 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  64.86 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 186 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 179 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  67.96 
 
 		 185 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 186 aa  259  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 		 180 aa  257  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 		 186 aa  257  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 		 179 aa  254  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 185 aa  254  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 186 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 185 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  62.22 
 
 		 185 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 183 aa  251  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 179 aa  251  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 182 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 185 aa  248  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  248  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  67.78 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 183 aa  247  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 183 aa  247  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  65.75 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 189 aa  244  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 178 aa  244  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 178 aa  244  6e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.71 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  65.75 
 
 		 185 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  62.29 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 185 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  244  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>