157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1229 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 		 324 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  46.93 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  37.24 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  37.2 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  36.61 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  38.12 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  38.15 
 
 		 344 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  36.01 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  38.74 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  37.15 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  35.42 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 360 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  35.74 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  33.43 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  34.21 
 
 		 843 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 355 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  28.05 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  32.95 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  28.92 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  29.94 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 342 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  29.22 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  27.03 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25.86 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  22.31 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  28.79 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  25.91 
 
 		 523 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26.57 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  21.56 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  45.21 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  43.48 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  25.9 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  24.92 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  26.47 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39046  FAD dependent oxidoreductase precursor  40.82 
 
 		 439 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2156  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  40.32 
 
 		 667 aa  49.3  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  47.54 
 
 		 503 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  39.13 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  52.27 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 482 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 490 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  40.62 
 
 		 670 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  39.02 
 
 		 421 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  38.33 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  40.62 
 
 		 670 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  36.28 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  44.44 
 
 		 506 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  52.27 
 
 		 490 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  39.68 
 
 		 506 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  52.27 
 
 		 487 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  41.38 
 
 		 493 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.85 
 
 		 506 aa  46.6  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  45.31 
 
 		 681 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1453  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.51 
 
 		 1067 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.551419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  43.1 
 
 		 689 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1596  putative oxidoreductase  32.35 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6235  putative oxidoreductase  32.35 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391718  normal  0.166247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  32.47 
 
 		 501 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  40.35 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5350  putative oxidoreductase  63.89 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.236159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6711  putative oxidoreductase  32.35 
 
 		 445 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717012  normal  0.546311 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  63.89 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>