More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1189 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  463  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  53.6 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  48.88 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  48.2 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  40.43 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  46.85 
 
 		 271 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  47.03 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  47.53 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  45.21 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  42.98 
 
 		 274 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  46.19 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  45.66 
 
 		 260 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  40.35 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  44.77 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  38.63 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  40.49 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  42.98 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  41.28 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  37.87 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.03 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  47.09 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  45.29 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  37.05 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  40.89 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  46.15 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  37.7 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  40.85 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  37.7 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  42.6 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  42.61 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  41.56 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  43.93 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  43.4 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.43 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.02 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.16 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  43.11 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  37.29 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  43.18 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  43.75 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  41.85 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  38.24 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  35.17 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  40.35 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  40.97 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.34 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  37.67 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  45.91 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  37.4 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  35.66 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  31.93 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  47.53 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  31.93 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  36.24 
 
 		 265 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  36.24 
 
 		 265 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.6 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  49.02 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  39.47 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  43.05 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  46.67 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.4 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  36.48 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  37.8 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  43.36 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.83 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  44.67 
 
 		 268 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  47.89 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  45.08 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  47.06 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.77 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  34.65 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  45.41 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>