More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1034 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 224 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  31 
 
 		 264 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 255 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 247 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 243 aa  87.8  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 221 aa  85.5  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.19 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  29.56 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.19 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  28.81 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1083  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  28.64 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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