More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0979 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0979  CBS  100 
 
 
313 aa  614  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  61.24 
 
 
314 aa  318  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  54.61 
 
 
322 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 
319 aa  209  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  38.73 
 
 
373 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  40.88 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
389 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  37.03 
 
 
377 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  37.86 
 
 
374 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  38.26 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  40.39 
 
 
345 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  37.22 
 
 
382 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  37.58 
 
 
384 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  37.22 
 
 
382 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  37.46 
 
 
375 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  34.96 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  37.26 
 
 
381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  34.12 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  35.16 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 
318 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  36.66 
 
 
376 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  41.85 
 
 
289 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  37.34 
 
 
386 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  43.05 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.76 
 
 
340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  34.3 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  36.5 
 
 
353 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  35.47 
 
 
371 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 
296 aa  160  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.96 
 
 
421 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  32.97 
 
 
285 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  41.43 
 
 
302 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  42.22 
 
 
315 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 
315 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.6 
 
 
420 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  37.5 
 
 
427 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  34.38 
 
 
273 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  34.73 
 
 
374 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  41.7 
 
 
312 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
435 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
310 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  33.96 
 
 
298 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  33.84 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.06 
 
 
433 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.47 
 
 
421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  36.23 
 
 
377 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.62 
 
 
445 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.47 
 
 
421 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  35.42 
 
 
383 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.62 
 
 
445 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.35 
 
 
434 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 
272 aa  142  7e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
287 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
275 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 
284 aa  142  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  30.4 
 
 
418 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  31.3 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  36.14 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  36.1 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.69 
 
 
299 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  33.68 
 
 
464 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.21 
 
 
429 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.43 
 
 
295 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.95 
 
 
284 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  32.13 
 
 
439 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  32.83 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  32.83 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  32.83 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.7 
 
 
439 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.13 
 
 
441 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.83 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  31.7 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  33.58 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 
419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  35.02 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 
433 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
291 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 
296 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
291 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  32.45 
 
 
291 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
291 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.29 
 
 
434 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  34.84 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  32.36 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  28.52 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  32.97 
 
 
464 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 
434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  34.39 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.38 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  32.97 
 
 
464 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>