More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0890 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
485 aa  960    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  67.47 
 
 
489 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  65.69 
 
 
481 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  52.3 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  55.19 
 
 
500 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  53.98 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  51.96 
 
 
500 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  53.22 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  52.58 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  52.37 
 
 
496 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  50.97 
 
 
496 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  52.62 
 
 
499 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  51.62 
 
 
500 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  52.77 
 
 
493 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  50.21 
 
 
542 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  51.74 
 
 
514 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  48.8 
 
 
498 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  52.03 
 
 
495 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  48.24 
 
 
539 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  51.09 
 
 
500 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  50.21 
 
 
497 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  50.99 
 
 
497 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 
499 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  48.5 
 
 
503 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  49.47 
 
 
497 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  50.77 
 
 
497 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  49.46 
 
 
500 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  49.23 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  50.54 
 
 
494 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  52.76 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  63.3 
 
 
497 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  51.84 
 
 
500 aa  388  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  51.85 
 
 
500 aa  380  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 
500 aa  375  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  54.42 
 
 
488 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  54.42 
 
 
489 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  47.37 
 
 
500 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  46.93 
 
 
500 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  49.63 
 
 
488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  54.16 
 
 
489 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  54.16 
 
 
489 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  56.51 
 
 
491 aa  342  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  45.39 
 
 
497 aa  333  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  43.2 
 
 
506 aa  332  6e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  58.98 
 
 
533 aa  329  8e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  43.15 
 
 
491 aa  319  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  46.28 
 
 
556 aa  318  9e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  51.72 
 
 
496 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  41.57 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0051  leucyl aminopeptidase  37 
 
 
559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  43.55 
 
 
496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 
488 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  42.83 
 
 
496 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.39 
 
 
492 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  48.35 
 
 
497 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  43.31 
 
 
496 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 
487 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  50.8 
 
 
521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.7 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 
500 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  49.07 
 
 
536 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0043  PepA aminopeptidase  40 
 
 
552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.727266  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  47.08 
 
 
498 aa  306  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  43.02 
 
 
503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  50.31 
 
 
500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  45.7 
 
 
486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  46.44 
 
 
495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
503 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
503 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  49.25 
 
 
492 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.94 
 
 
496 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 
503 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 
497 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  42.74 
 
 
510 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
496 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  42.26 
 
 
514 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  47.85 
 
 
510 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  45.26 
 
 
522 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0053  leucyl aminopeptidase  37.22 
 
 
548 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  40.63 
 
 
497 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  40.42 
 
 
497 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  48.29 
 
 
479 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  42.95 
 
 
507 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
495 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 
518 aa  296  7e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 
503 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 
503 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.42 
 
 
497 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
506 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 
503 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  47.38 
 
 
536 aa  294  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2018  leucyl aminopeptidase  42.48 
 
 
490 aa  294  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.65 
 
 
503 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>