180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0872 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  820    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 467 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  39.9 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  39.33 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  39.56 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  40.14 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  36.54 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  37.77 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  37.77 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  36.87 
 
 		 424 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  37.19 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  36.86 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  37.29 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  37.94 
 
 		 428 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  37.53 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  36.92 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  36.92 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  36.92 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  36.92 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  36.92 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  39.17 
 
 		 410 aa  235  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  36.67 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  37.29 
 
 		 431 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  37.9 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  37.62 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  37.29 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  37.66 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  37.59 
 
 		 435 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  38.48 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  36.54 
 
 		 435 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  39.85 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  37.68 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  40.92 
 
 		 427 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  38.42 
 
 		 426 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  39.05 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  37.83 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  37.29 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  38.76 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  37.63 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  38.03 
 
 		 412 aa  220  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  36.93 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  35.41 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  36.39 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  34.4 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  35.78 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  35.21 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  33.74 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  32.67 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.74 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  31.76 
 
 		 468 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.99 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.09 
 
 		 458 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  33.17 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  33.92 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.98 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.28 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  30.45 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  28.71 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  28.42 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  28.71 
 
 		 457 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  28.71 
 
 		 457 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  36.39 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  31.94 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  30.81 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.4 
 
 		 431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  29.33 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.65 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  30.44 
 
 		 438 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  31.5 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  31.5 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  31.5 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  31.5 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  31.5 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  28.47 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  30.13 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  29.87 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  31.23 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  26.42 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  31.41 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  29.85 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  27.09 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  30.43 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.93 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.34 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0801  L-fucose transporter  28.54 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  29.55 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  26.5 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0750  fucose permease  26.73 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000880356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  30.57 
 
 		 429 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  30.42 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01616  putative fucose permease  31.25 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000108257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  27.59 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  27.12 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>