143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0842 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0842  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  57.21 
 
 
214 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  58.96 
 
 
390 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  48.84 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  48.37 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  46.26 
 
 
218 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  45.33 
 
 
214 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  45.58 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3760  putative low-affinity phosphate transport accessory protein  43.72 
 
 
214 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  45.33 
 
 
214 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  43.72 
 
 
214 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2032  hypothetical protein  44.19 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635616  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  45.79 
 
 
213 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  45.33 
 
 
213 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  44.86 
 
 
213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  43.93 
 
 
214 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  42.79 
 
 
214 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  33.95 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  33.02 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  33.02 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  33.95 
 
 
208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  31.65 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  33.02 
 
 
208 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  31.65 
 
 
215 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  33.94 
 
 
215 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  33.94 
 
 
215 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  32.57 
 
 
215 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  32.23 
 
 
211 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  33.18 
 
 
211 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  32.09 
 
 
208 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  32.7 
 
 
211 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  32.11 
 
 
215 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  32.23 
 
 
211 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  32.57 
 
 
215 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  32.09 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  32.23 
 
 
211 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  31.16 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  32.09 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  33.49 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  30.7 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  31.75 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.05 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  30.7 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  31.53 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  28.9 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  32.27 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  29.36 
 
 
205 aa  95.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  30.41 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  31.63 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  32.04 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  27.98 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  29.36 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  29.36 
 
 
205 aa  92  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  27.52 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  27.52 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  31.94 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  31.1 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  32.38 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  30.14 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  29.25 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  32.06 
 
 
209 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  32.06 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  26.05 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  31.13 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  26.32 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  25.47 
 
 
208 aa  85.1  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  27.1 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  26.91 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  31.19 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  26.73 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  29.11 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  27.75 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  27.88 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  30.66 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  29.52 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  26.09 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  27.54 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  26.4 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  27.62 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  26.97 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  26.97 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  27.88 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  25.96 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>