117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0814 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 111 aa  232  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  63.27 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2430  excinuclease ABC subunit C  65.35 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  65 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3101  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  61.8 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1144  hypothetical protein  57.89 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0733  excinuclease ABC subunit C  59.41 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.579236  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2524  excinuclease ABC subunit C  58.76 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3180  excinuclease ABC subunit C  57.78 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734981  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  62.35 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3175  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00936772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7339  putative excinuclease ABC, C subunit  56.7 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4225  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.18 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0073463  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0358  endo/excinuclease amino terminal domain-containing protein  56.47 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.14 
 
 		 96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  53.61 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0294  hypothetical cytosolic protein  55.68 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.479939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1899  GIY-YIG catalytic domain-containing protein  55.68 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  60 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2291  excinuclease ABC subunit C  55.68 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361879  normal  0.317834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3382  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114521  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2352  excinuclease ABC subunit C  51.58 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.51382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0916  excinuclease ABC subunit C  61.18 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.61 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1975  excinuclease ABC subunit C  53.47 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  53 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1409  excinuclease ABC subunit C  53.93 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2855  Excinuclease ABC C subunit domain protein  56.98 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5085  Excinuclease ABC C subunit domain protein  51.65 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.88934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2181  excinuclease ABC subunit C  52.04 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00892068  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0101  excinuclease ABC subunit C  51.61 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.873181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0285  excinuclease ABC subunit C  57.3 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.722146  normal  0.992997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  51.11 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2226  excinuclease ABC subunit C  50.55 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.163339  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1328  excinuclease ABC subunit C  55.56 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  54.12 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  47.78 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2807  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.171123  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3672  excinuclease ABC subunit C  52.17 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.246174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0877  excinuclease ABC subunit C  49.02 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  53.33 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0957  excinuclease ABC subunit C  50 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00735212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0039  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0331  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0717  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0882  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1812  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1852  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1944  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2051  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2896  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2878  excinuclease ABC subunit C  49.46 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00418139  hitchhiker  0.000396722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3151  excinuclease ABC subunit C  50.56 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0891506  normal  0.0226516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1053  excinuclease ABC, C subunit  46.07 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.175656  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  50.54 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0883  excinuclease ABC subunit C  48.98 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227593  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  47.31 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4056  excinuclease ABC subunit C  48.94 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05260  endo/excinuclease amino terminal domain protein  43.75 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.509703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05250  endo/excinuclease amino terminal domain protein  43.56 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0893  excinuclease ABC subunit C  44.79 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0827  excinuclease ABC subunit C  46.88 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2889  excinuclease ABC subunit C  48.39 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0492999  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4684  excinuclease ABC subunit C  50.59 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.11 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0767  excinuclease ABC subunit C  43.82 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.464931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2057  excinuclease ABC subunit C  48.84 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1655  excinuclease ABC subunit C  54.26 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0895  Excinuclease ABC C subunit domain protein  42.86 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  49.41 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4264  excinuclease ABC subunit C  44.44 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604611  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09001  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4036  hypothetical protein  51.47 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2914  excinuclease ABC subunit C  45.35 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00677745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1277  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.7 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01100  hypothetical protein  46.77 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05270  hypothetical protein  37.04 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1913  hypothetical protein  36.26 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.915766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3906  excinuclease ABC subunit C  41.94 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647444  normal  0.105898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2225  hypothetical protein  55.26 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1622  excinuclease ABC subunit C  63.16 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2245  excinuclease ABC subunit C  39.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3514  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.09 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  39.08 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  39.08 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1038  hypothetical protein  36.71 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4267  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2665  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.71 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0964299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  35.48 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00714  hypothetical protein  55.88 
 
 		 37 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.77 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.94 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1435  excinuclease ABC subunit C  40.24 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1431  GIY-YIG domain-containing protein  31.87 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00206814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>