216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0805 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  100 
 
 
420 aa  852    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  56.79 
 
 
419 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  48.81 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  45.16 
 
 
388 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  47.68 
 
 
402 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  45.66 
 
 
390 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  42.02 
 
 
438 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  46.72 
 
 
363 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  42.34 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  38.79 
 
 
433 aa  249  7e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  35.37 
 
 
429 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  37.47 
 
 
402 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  38.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  34.88 
 
 
415 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  37.87 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  33.5 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  37.11 
 
 
444 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  36.93 
 
 
412 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  32.81 
 
 
311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  37.79 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3815  membrane dipeptidase  37.79 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  31.06 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  30.83 
 
 
333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30 
 
 
311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  32.73 
 
 
312 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.68 
 
 
602 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  34.47 
 
 
307 aa  176  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  30.12 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  28.61 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  31.78 
 
 
315 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3591  membrane dipeptidase  31.41 
 
 
428 aa  159  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  28.46 
 
 
412 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  27.29 
 
 
409 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.19 
 
 
315 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.23 
 
 
338 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  29.15 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3875  membrane dipeptidase  27.88 
 
 
449 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  27.73 
 
 
345 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  26.88 
 
 
313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4253  Membrane dipeptidase  28.74 
 
 
359 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655109  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1459  peptidase M19, renal dipeptidase  28.29 
 
 
392 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0893597  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  36.06 
 
 
350 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  25.7 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0651  Membrane dipeptidase  27.74 
 
 
419 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.720054  normal  0.102026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.54 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  26.63 
 
 
345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  25.48 
 
 
328 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3582  peptidase M19, renal dipeptidase  30.5 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1194  Membrane dipeptidase  28.49 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000135749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  24.86 
 
 
307 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03501  dipeptidase  28.76 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.41 
 
 
315 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.72 
 
 
355 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  28.01 
 
 
342 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  25.08 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  27.34 
 
 
360 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  26.27 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  25.78 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  30.31 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1853  peptidase M19, renal dipeptidase  25.19 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1966  peptidase M19, renal dipeptidase  28.12 
 
 
464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0692763  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2156  renal dipeptidase family protein  28.12 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0303403  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1643  peptidase M19, renal dipeptidase  24.49 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  26.23 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  24.23 
 
 
307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2089  Membrane dipeptidase  26.26 
 
 
307 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  29.5 
 
 
352 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.71 
 
 
346 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.85 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  25.45 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  24.48 
 
 
348 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1425  renal dipeptidase family protein  25.07 
 
 
307 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0826575  normal  0.836876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4213  dipeptidase, putative  27.34 
 
 
462 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3785  peptidase M19 renal dipeptidase  27.17 
 
 
448 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4181  peptidase M19 renal dipeptidase  28.89 
 
 
352 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  23.22 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  23.22 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  23.22 
 
 
307 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3537  peptidase M19 renal dipeptidase  28.01 
 
 
450 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  25.19 
 
 
346 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  28.15 
 
 
342 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.84 
 
 
355 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.84 
 
 
355 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3534  renal dipeptidase family protein  23.61 
 
 
307 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00478646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  23.35 
 
 
307 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  23.77 
 
 
307 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2866  putative dipeptidase precursor  27.17 
 
 
448 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  23.27 
 
 
307 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  28.35 
 
 
352 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  31.49 
 
 
307 aa  106  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33730  putative dipeptidase precursor  26.81 
 
 
448 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.180184  hitchhiker  0.00270503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  26.79 
 
 
342 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25440  Peptidase M19, renal dipeptidase.PvdM-like protein  26.1 
 
 
423 aa  103  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  24.48 
 
 
323 aa  103  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  23.96 
 
 
323 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  27.01 
 
 
357 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  23.27 
 
 
307 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  30.12 
 
 
355 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  27.89 
 
 
397 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  30.22 
 
 
393 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.394011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>