More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0797 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 476 aa  962    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  54.27 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  52.23 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  52.65 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  51.16 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  48.95 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.11 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 481 aa  441  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.16 
 
 		 478 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  48.84 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  49.22 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  49.69 
 
 		 479 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  47.89 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  48.2 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  47.98 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  50.21 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  48.84 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  47.8 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 		 480 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  48.2 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.53 
 
 		 496 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  48.41 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.41 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.63 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 485 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  47.15 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  48.83 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  49.68 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  47.36 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  48.41 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  47.68 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.26 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.2 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.67 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  47.68 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  49.68 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  45.26 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  46.28 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  44.82 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  45.67 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  49.47 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  43.14 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  42.22 
 
 		 476 aa  362  9e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 487 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.34 
 
 		 483 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.33 
 
 		 493 aa  345  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.3 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.3 
 
 		 480 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  40.3 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.81 
 
 		 497 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 500 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.67 
 
 		 491 aa  340  5e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.87 
 
 		 483 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 485 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.61 
 
 		 480 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.19 
 
 		 480 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.66 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.47 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 486 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.55 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 489 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.39 
 
 		 492 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 479 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.42 
 
 		 482 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 479 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.53 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.86 
 
 		 490 aa  332  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.35 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.32 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2373  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 486 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.42 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.19 
 
 		 483 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  39.66 
 
 		 483 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07315  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  39.41 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.223586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 495 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.75 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.2 
 
 		 482 aa  329  6e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.36 
 
 		 484 aa  329  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>