More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0712 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  754    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  51.12 
 
 
374 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  48.1 
 
 
374 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  41.19 
 
 
376 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  44.78 
 
 
372 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  42.73 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  39.13 
 
 
376 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  43.71 
 
 
379 aa  269  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  41.76 
 
 
379 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  39.26 
 
 
376 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  36.22 
 
 
376 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  36.29 
 
 
399 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  36.12 
 
 
376 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  38.96 
 
 
373 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  37 
 
 
377 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  35.47 
 
 
376 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  36.78 
 
 
361 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  31.01 
 
 
369 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  31.86 
 
 
369 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  35.96 
 
 
374 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  30.08 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  29.64 
 
 
377 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  31.99 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  30.56 
 
 
395 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.87 
 
 
378 aa  126  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  31.12 
 
 
391 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  31.12 
 
 
391 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.32 
 
 
392 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  31.36 
 
 
397 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 
374 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.43 
 
 
389 aa  123  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.23 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  30.41 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.8 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  30.68 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  31.07 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.66 
 
 
377 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  30.75 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  29.78 
 
 
382 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  29.86 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  33.43 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  30.17 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.85 
 
 
382 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1093  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 
408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0291534  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  34.56 
 
 
377 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  30.09 
 
 
364 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 
421 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  30.09 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  29.79 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  33.54 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  29.57 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  28.36 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  30.38 
 
 
388 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.6 
 
 
360 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  30.46 
 
 
388 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  27.83 
 
 
402 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  25.95 
 
 
377 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  30.86 
 
 
377 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.17 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  29.55 
 
 
396 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  32.67 
 
 
400 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.49 
 
 
399 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 
390 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.92 
 
 
404 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 
397 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 
398 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
387 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  31.12 
 
 
378 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 
410 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  29.7 
 
 
384 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  31.16 
 
 
393 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 
382 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  31.91 
 
 
369 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 
408 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  32.11 
 
 
399 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 
404 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00140  conserved hypothetical protein  29.47 
 
 
419 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.180406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
367 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 
392 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.94 
 
 
376 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.86 
 
 
377 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.38 
 
 
422 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  29.23 
 
 
404 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 
376 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  33.14 
 
 
369 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  33.14 
 
 
404 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  32.09 
 
 
395 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 
412 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  31.48 
 
 
400 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  25.37 
 
 
377 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  34.15 
 
 
373 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1565  monooxygenase FAD-binding  31.3 
 
 
384 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  30.68 
 
 
385 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  55 
 
 
123 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  33.83 
 
 
385 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  28.24 
 
 
390 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>