268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0711 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  100 
 
 
410 aa  805    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  36.55 
 
 
402 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  32.4 
 
 
414 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  30.89 
 
 
409 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  30.53 
 
 
403 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  31.73 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  30.89 
 
 
409 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  26.67 
 
 
397 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
388 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  30.9 
 
 
409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  28.57 
 
 
409 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  28.57 
 
 
409 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  29.26 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.38 
 
 
421 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
381 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  27.91 
 
 
405 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.71 
 
 
423 aa  100  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25.71 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.42 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  29.03 
 
 
404 aa  97.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  27.89 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  24.72 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  25.94 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  30.83 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  27.54 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.12 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  28.53 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.16 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  25.35 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  27.7 
 
 
332 aa  61.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  33.13 
 
 
519 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  26.26 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0961  major facilitator transporter  24.87 
 
 
414 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4370  major facilitator transporter  24.23 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1354  major facilitator transporter  24.23 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00928923  normal  0.137177 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  29.21 
 
 
514 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.13 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.27 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  29.5 
 
 
428 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
415 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  20.3 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  26.9 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
480 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  25.97 
 
 
385 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.75 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.85 
 
 
410 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4495  major facilitator transporter  22.8 
 
 
414 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.662231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  25.35 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.75 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.58 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
523 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.75 
 
 
401 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.67 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 
513 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
503 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
488 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
513 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.06 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.21 
 
 
396 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
482 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.06 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 
513 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  28.92 
 
 
480 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  28.99 
 
 
481 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
425 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  33.78 
 
 
413 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0494  molybdopterin biosynthesis protein  24.59 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  26.32 
 
 
482 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  23.23 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
507 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
508 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
495 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.4 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  25.34 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.03 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
525 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  26.03 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  32.5 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  29.27 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.65 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  24.66 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>