44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0699 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  51.83 
 
 
177 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  53.94 
 
 
176 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  39.78 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  40 
 
 
238 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  36 
 
 
240 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  37.14 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  37.19 
 
 
246 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  38.01 
 
 
238 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  38.24 
 
 
241 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  38.04 
 
 
241 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  37.14 
 
 
241 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  36.96 
 
 
202 aa  100  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 
245 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  37.65 
 
 
245 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  38.41 
 
 
207 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  35.11 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  35.26 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  39.07 
 
 
300 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  34.08 
 
 
218 aa  92  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  38.41 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  36.05 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  37.32 
 
 
232 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  37.7 
 
 
226 aa  87.8  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  35.76 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  31.75 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  31.28 
 
 
300 aa  81.3  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  32.92 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  35.21 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  32.02 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  35.59 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.07 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  31.29 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  29.78 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  30.34 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  32.03 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.21 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  25.16 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  35.61 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.9 
 
 
264 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  22.6 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>