234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0685 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  135  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 67 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  60.94 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  59.09 
 
 		 66 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 66 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  57.58 
 
 		 66 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  59.09 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  56.06 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  58.21 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  62.12 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 67 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  59.7 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  58.21 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  56.92 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  55.22 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  55.22 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  62.3 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  60.66 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  54.55 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  39.39 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  42.42 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  46.03 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf193  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000550484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0347  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50.82 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  42.19 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  42.86 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>