More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0596 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0596  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
270 aa  541  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.717834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4885  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  69.26 
 
 
270 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.512414  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3187  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  62.96 
 
 
270 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.186382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4210  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.06 
 
 
283 aa  289  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3029  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.24 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5075  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.39 
 
 
287 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4512  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.48 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1339  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.3 
 
 
283 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0008  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.3 
 
 
283 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1723  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.62 
 
 
275 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3369  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.24 
 
 
284 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2592  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.46 
 
 
283 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0171535  decreased coverage  0.0000000235348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3550  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.76 
 
 
286 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1004  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.4 
 
 
289 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.838734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3659  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.51 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.713719999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2096  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.6 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.026962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3307  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.12 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_004310  BR2183  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.6 
 
 
293 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.770592  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.42 
 
 
302 aa  251  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4046  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.64 
 
 
299 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.800255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4416  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.98 
 
 
299 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4100  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.65 
 
 
297 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0080  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.12 
 
 
293 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0452  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.96 
 
 
288 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.112388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0087  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.42 
 
 
291 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4528  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.3 
 
 
296 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.49 
 
 
296 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246645  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1221  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.08 
 
 
291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4368  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.85 
 
 
301 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0377  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.44 
 
 
293 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7054  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.94 
 
 
297 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4639  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.61 
 
 
296 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0230348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0619  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.23 
 
 
293 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0236093  normal  0.724235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3033  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.86 
 
 
292 aa  234  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0212  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.92 
 
 
293 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0048  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.39 
 
 
293 aa  234  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.683783  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3076  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.04 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6254  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.94 
 
 
297 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0389  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.82 
 
 
297 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3573  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.95 
 
 
306 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3690  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.06 
 
 
271 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0040  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.08 
 
 
293 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.733521  normal  0.608589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03200  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  47.99 
 
 
271 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3799  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.04 
 
 
281 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127595  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.55 
 
 
271 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3886  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.22 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0146  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.03 
 
 
270 aa  220  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0210  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.22 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4726  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.22 
 
 
271 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3924  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.42 
 
 
271 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0078  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.12 
 
 
271 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1864  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.79 
 
 
271 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00234848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0319  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  46.52 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.12 
 
 
273 aa  215  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00226258  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3749  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.22 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.05 
 
 
270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.890377  normal  0.0669728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1921  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.66 
 
 
280 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2000  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.62 
 
 
271 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00657  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.49 
 
 
269 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3623  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.79 
 
 
272 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0599  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.07 
 
 
274 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001817  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.76 
 
 
269 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000220306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0616  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  39.71 
 
 
274 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0383  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.32 
 
 
270 aa  208  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0997  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.69 
 
 
271 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1621  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.09 
 
 
275 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39022  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4097  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.32 
 
 
269 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0739878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4104  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  42.86 
 
 
271 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2649  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.09 
 
 
277 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3674  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.12 
 
 
271 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000210718  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2969  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.36 
 
 
281 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.158324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3072  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.52 
 
 
271 aa  204  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0162  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  46.52 
 
 
269 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2758  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.59 
 
 
270 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2378  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.59 
 
 
270 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.067562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3957  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.26 
 
 
269 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3881  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.59 
 
 
271 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3974  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.96 
 
 
271 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4084  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.59 
 
 
271 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0075  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.22 
 
 
271 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.495543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4324  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.22 
 
 
271 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0582  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.17 
 
 
272 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4387  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.48 
 
 
269 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00707476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.54 
 
 
272 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0188  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.54 
 
 
272 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4269  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.85 
 
 
271 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4464  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.85 
 
 
271 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2311  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  45.59 
 
 
270 aa  201  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  37.36 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.384452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04870  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  40.51 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000175141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0055  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.18 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0268618  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.18 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0143  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.18 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.497786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0126  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  41.18 
 
 
271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.270322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3726  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.96 
 
 
277 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0479  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44.6 
 
 
276 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4839  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.96 
 
 
269 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000052182  hitchhiker  0.0000379227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0589  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.88 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362043  decreased coverage  0.000844173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2648  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  41.03 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00588455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00058  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  44 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>