More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0594 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 
519 aa  1045    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  76.94 
 
 
514 aa  751    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  69.89 
 
 
510 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.95 
 
 
508 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45 
 
 
524 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.32 
 
 
534 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.15 
 
 
527 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.27 
 
 
527 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.51 
 
 
527 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.63 
 
 
524 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.95 
 
 
509 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.51 
 
 
517 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.32 
 
 
524 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.24 
 
 
520 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.95 
 
 
529 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.45 
 
 
511 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.36 
 
 
509 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.54 
 
 
524 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.94 
 
 
520 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.11 
 
 
509 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.24 
 
 
509 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.94 
 
 
521 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.24 
 
 
517 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.42 
 
 
493 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.18 
 
 
527 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.54 
 
 
526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.71 
 
 
522 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.66 
 
 
518 aa  362  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.66 
 
 
524 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.85 
 
 
523 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.71 
 
 
519 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.8 
 
 
525 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.95 
 
 
524 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  46.95 
 
 
524 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.66 
 
 
523 aa  349  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.14 
 
 
512 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  44.84 
 
 
525 aa  346  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.57 
 
 
520 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  42.61 
 
 
476 aa  335  1e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.89 
 
 
500 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  40.72 
 
 
542 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.46 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.62 
 
 
546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
522 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  42.07 
 
 
553 aa  309  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.69 
 
 
547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.06 
 
 
506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.38 
 
 
558 aa  303  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.17 
 
 
553 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.81 
 
 
509 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.95 
 
 
561 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.13 
 
 
480 aa  301  3e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.46 
 
 
521 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.14 
 
 
525 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  37.96 
 
 
549 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.48 
 
 
480 aa  298  2e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.88 
 
 
547 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.58 
 
 
525 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.58 
 
 
525 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.56 
 
 
504 aa  296  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  37.47 
 
 
549 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3641  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.99 
 
 
522 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.302348  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.83 
 
 
517 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.37 
 
 
546 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.97 
 
 
534 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.44 
 
 
517 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.57 
 
 
525 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.72 
 
 
521 aa  293  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.72 
 
 
521 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.33 
 
 
522 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.77 
 
 
543 aa  289  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.45 
 
 
525 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  36.34 
 
 
544 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.77 
 
 
544 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.76 
 
 
521 aa  287  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.12 
 
 
521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.79 
 
 
514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.14 
 
 
551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.39 
 
 
552 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0637  putative ubiquinone biosynthesis protein  35.68 
 
 
458 aa  282  1e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.92 
 
 
537 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.69 
 
 
525 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.17 
 
 
544 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.59 
 
 
539 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.91 
 
 
556 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.97 
 
 
552 aa  280  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.6 
 
 
540 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  36.61 
 
 
541 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.81 
 
 
549 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.6 
 
 
540 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.05 
 
 
549 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.05 
 
 
549 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.12 
 
 
544 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.19 
 
 
525 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.66 
 
 
525 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.96 
 
 
549 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.66 
 
 
525 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.66 
 
 
525 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.05 
 
 
549 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.05 
 
 
549 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>