More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0577 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  140  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  85.51 
 
 
70 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  68.12 
 
 
70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  71.01 
 
 
69 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
70 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  55.07 
 
 
70 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  60.61 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  60.87 
 
 
80 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60.87 
 
 
84 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
87 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  55.07 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  56.52 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  53.62 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  53.62 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 
75 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  59.09 
 
 
70 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  53.62 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
69 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
79 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
79 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0083  hypothetical protein  53.62 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.246175  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  59.09 
 
 
73 aa  84.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  55.07 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.52 
 
 
74 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
76 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  56.06 
 
 
214 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  56.52 
 
 
86 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  57.97 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  52.17 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  60.61 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  50.72 
 
 
72 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  50.72 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  52.17 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.07 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  53.85 
 
 
76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  53.62 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  47.89 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  55.07 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  50.72 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  52.31 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  53.03 
 
 
206 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  50.72 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3489  protein of unknown function DUF37  51.43 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00923771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50.72 
 
 
93 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  52.94 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  52.17 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  56.06 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  47.83 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  49.25 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50.72 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  53.73 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  55.88 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50.75 
 
 
77 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  53.03 
 
 
84 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  51.61 
 
 
104 aa  76.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  53.73 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  57.35 
 
 
84 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1110  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  52.24 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.69 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  49.28 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  52.94 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>