More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0536 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  84.54 
 
 		 310 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  69.64 
 
 		 304 aa  440  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  66.23 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  66.12 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  62.62 
 
 		 325 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  60.06 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  63.75 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  65.02 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  61.06 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  63.34 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  58.69 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  59.54 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  60.33 
 
 		 322 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  58.88 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  56.81 
 
 		 332 aa  346  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  58.36 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  57.76 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  57.1 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  53.69 
 
 		 291 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  54.13 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  54.7 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  54.7 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  54.36 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  51.48 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  51.07 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  52.51 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  53.36 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  53.36 
 
 		 291 aa  285  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.17 
 
 		 367 aa  281  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  51.84 
 
 		 294 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  51.99 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  48.54 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  52.17 
 
 		 299 aa  279  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  48.2 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  47.81 
 
 		 409 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  49.68 
 
 		 337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  48.59 
 
 		 384 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  48.74 
 
 		 421 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  48.74 
 
 		 377 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  48.12 
 
 		 390 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  48.51 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  50.17 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  48.01 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  46.88 
 
 		 408 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  47.51 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  48.2 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  47.85 
 
 		 358 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  53.31 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  46.03 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  46.33 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.69 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  44.27 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  44.37 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  45.45 
 
 		 375 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  46.15 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.48 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  44.44 
 
 		 303 aa  218  7.999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  43.37 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.97 
 
 		 361 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.84 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  39.25 
 
 		 349 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.55 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  40.97 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.69 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  39.87 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.38 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40.65 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  41.61 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  40.32 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  38.97 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  42.76 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  37.32 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  35.14 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.18 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.19 
 
 		 751 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  32.53 
 
 		 510 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.6 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  30.62 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  29 
 
 		 614 aa  96.7  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.29 
 
 		 742 aa  95.9  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  30.19 
 
 		 433 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.61 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  28.47 
 
 		 481 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2915  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000535404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.31 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.65 
 
 		 439 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  32.26 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.71 
 
 		 517 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.89 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.94 
 
 		 826 aa  90.5  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.25 
 
 		 586 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.87 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  26.06 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.8 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.22 
 
 		 468 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.42 
 
 		 517 aa  86.7  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  34.92 
 
 		 398 aa  85.9  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>