163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0521 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 288 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  33.49 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  34.3 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  34.31 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  46.58 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  43.53 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  50.7 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  43.53 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  49.21 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 313 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 340 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 352 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 290 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 354 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  35.83 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  42.47 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  28.66 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  57.45 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  57.45 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 235 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  50.85 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  50.85 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  36.99 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>