More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0473 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 435 aa  867    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  64.14 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  65.86 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  52.13 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3811  Ppx/GppA phosphatase  45.83 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000504204  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  46.91 
 
 		 498 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0471  Ppx/GppA phosphatase  49.22 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  46.91 
 
 		 498 aa  292  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  48.21 
 
 		 375 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3082  Ppx/GppA phosphatase  48.3 
 
 		 366 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  43.88 
 
 		 520 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  48.62 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  48.62 
 
 		 603 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0246  Ppx/GppA phosphatase  48.48 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944048  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2489  Ppx/GppA phosphatase  50.46 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.552862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0836  Ppx/GppA phosphatase  48.82 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  42.42 
 
 		 509 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  49.69 
 
 		 357 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3197  Ppx/GppA phosphatase  49.38 
 
 		 358 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.366219  normal  0.365881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3742  Ppx/GppA phosphatase  44.02 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3433  Ppx/GppA phosphatase  44.02 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2258  Ppx/GppA phosphatase  47.06 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.613366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  47.99 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3629  Ppx/GppA phosphatase  43.7 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  46.38 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2151  Ppx/GppA phosphatase  47.56 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2550  Ppx/GppA phosphatase  48.26 
 
 		 331 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2012  Ppx/GppA phosphatase  42.78 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1673  phosphatase  41.76 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131499  normal  0.356135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1413  Ppx/GppA phosphatase  42.69 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.899781  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1031  Ppx/GppA phosphatase  42.4 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2771  putative exopolyphosphatase  42.69 
 
 		 378 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.571811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0142  Ppx/GppA phosphatase  46.11 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279399  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1183  Ppx/GppA phosphatase  41.06 
 
 		 370 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3989  Ppx/GppA phosphatase  42.43 
 
 		 374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1980  Ppx/GppA phosphatase  39.45 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.307298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1927  Ppx/GppA phosphatase  44.9 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1331  Ppx/GppA phosphatase  43.75 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0093  Ppx/GppA phosphatase  43.2 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  34.38 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  30.95 
 
 		 550 aa  143  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  35.69 
 
 		 303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  32.7 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  30.16 
 
 		 305 aa  137  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  35.37 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  35.62 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  34.95 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  29.56 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  31.76 
 
 		 570 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 		 523 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  33.85 
 
 		 568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  36.08 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  32.29 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  35.08 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  30.66 
 
 		 557 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  28.12 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  30.53 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  36.16 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  34.56 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.66 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  32.18 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  30.12 
 
 		 544 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  37.34 
 
 		 307 aa  127  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  33.54 
 
 		 505 aa  126  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  30.12 
 
 		 544 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.87 
 
 		 532 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  29.38 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  29.25 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  29.02 
 
 		 300 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  34.65 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  30.94 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  35.67 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  33.9 
 
 		 333 aa  123  7e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  33.94 
 
 		 323 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1566  polyPpx/GppA family phosphatase  30.23 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  31.61 
 
 		 501 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  29.79 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  33.12 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  34.34 
 
 		 326 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  30.7 
 
 		 513 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  30.31 
 
 		 539 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  34.48 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.63 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  32.23 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  35.08 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  32.81 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  30.31 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  30.6 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  35.17 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  29.35 
 
 		 519 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  28.48 
 
 		 531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.01 
 
 		 544 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>