35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0350 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0350  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  100 
 
 		 687 aa  1381    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  42.44 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  45.37 
 
 		 426 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4619  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.74 
 
 		 436 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000187053  hitchhiker  0.0000000628519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  31.25 
 
 		 418 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  28.85 
 
 		 424 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1011  5-methylcytosine restriction system component-like protein  31.02 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000144218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  39.2 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  32.06 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3270  hypothetical protein  26.33 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0179938  normal  0.335413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  27.71 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0993  hypothetical protein  24.31 
 
 		 437 aa  72  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.235646  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  29.11 
 
 		 445 aa  72  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  26.8 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  30.98 
 
 		 438 aa  72  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  26.8 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  29.72 
 
 		 435 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  26.14 
 
 		 445 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1299  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  28 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217939  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  36.97 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  29.95 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  22.27 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0437  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  35.9 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  hitchhiker  0.00000000000258291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.22 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3470  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  28.73 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00801853  normal  0.511219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0806  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  24.58 
 
 		 383 aa  52.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0894928  hitchhiker  0.000053751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  28.05 
 
 		 436 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3197  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  27.27 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0398257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4768  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  29.41 
 
 		 407 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.393001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05460  McrBC 5-methylcytosine restriction system component  27.22 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  32.98 
 
 		 251 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3582  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  25 
 
 		 405 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2183  excinuclease ABC, A subunit  36.94 
 
 		 945 aa  44.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.666287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>