More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0284 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 401 aa  819    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  85.32 
 
 		 402 aa  679    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  76.28 
 
 		 406 aa  624  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  63.66 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  65.66 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  60.85 
 
 		 393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  60.75 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  61.25 
 
 		 393 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  60.99 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  60.79 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  59.61 
 
 		 398 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  60.79 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  60.58 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  60.64 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  61.63 
 
 		 392 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  60.55 
 
 		 391 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 398 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  59.61 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  58.64 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  59.41 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  59.3 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  58.15 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  58.39 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  59.41 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  59 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  59.45 
 
 		 395 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  58.8 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  59 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  59.04 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  58.75 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  57.76 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.3 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  56.13 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  58.51 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  54.48 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  54.3 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  55.66 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  56.13 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 		 388 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  54.89 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  54.05 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  52.94 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  53.47 
 
 		 385 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  52.61 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  54.75 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  51.72 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  53.22 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  54.04 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  52.7 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  54.04 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  53.68 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  55.82 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  51.84 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  51.84 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  53.22 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  54.95 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  52.99 
 
 		 389 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  52.76 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  51.85 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  51.47 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  54.91 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1777  S-adenosylmethionine synthetase  51.64 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  54.91 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  52.84 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  53.5 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  51.76 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  51.26 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  51.74 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  52.1 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0808  S-adenosylmethionine synthetase  52.87 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  53.56 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  51.74 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  51.26 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  51.74 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  52.01 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  52.01 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  52.72 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  51.74 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  51.74 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  52.01 
 
 		 383 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  51.97 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  49.88 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  51.13 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  50.88 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  51.89 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  53 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>