More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0267 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  66.36 
 
 
216 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  63.82 
 
 
204 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  42.11 
 
 
219 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  43.81 
 
 
223 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.23 
 
 
223 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  42.05 
 
 
214 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.49 
 
 
222 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  42.49 
 
 
222 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
223 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  41.97 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  39.6 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  42.05 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.67 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  41.84 
 
 
225 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  41.15 
 
 
214 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  42.56 
 
 
224 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  40.72 
 
 
224 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.3 
 
 
222 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  39.9 
 
 
222 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.06 
 
 
221 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  44.62 
 
 
215 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.2 
 
 
227 aa  131  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.62 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  39.49 
 
 
224 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  41.86 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  41.75 
 
 
224 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  40 
 
 
224 aa  125  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  38.5 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.56 
 
 
222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  42.56 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.05 
 
 
222 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.8 
 
 
231 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  38.62 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.93 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  33.97 
 
 
239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.3 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  38.5 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.31 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  31.58 
 
 
220 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.6 
 
 
218 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  43.09 
 
 
231 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  41.94 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  41.46 
 
 
231 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  42.34 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.93 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.75 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  40.32 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  44.35 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  31.84 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  35.48 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  42.71 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  37.38 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  39.25 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  38.32 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  31.87 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  40.82 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  29.17 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  40.59 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  45.45 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  30.81 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 
840 aa  68.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  41.51 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.32 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.21 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  33.91 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  39.32 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  40.18 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.69 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  40.21 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  39.18 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  29.9 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  36.43 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.31 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  26 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.35 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 
224 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  35.9 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  30.33 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.58 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.26 
 
 
828 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 
843 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 
835 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.77 
 
 
835 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  40 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  29.03 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 
265 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.69 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  26.29 
 
 
813 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  28.21 
 
 
812 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.02 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 
812 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  40.23 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.64 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  24.61 
 
 
814 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>