More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0266 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  100 
 
 
301 aa  593  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  65.02 
 
 
303 aa  351  7e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
298 aa  321  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  44.72 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  41.05 
 
 
317 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  38.78 
 
 
306 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  43.66 
 
 
304 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  38.44 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  39.3 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  43.51 
 
 
304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  39.08 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  41.4 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  40.97 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  38.59 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  41.11 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  38.6 
 
 
324 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  38.1 
 
 
306 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  40.97 
 
 
300 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  41.52 
 
 
302 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  41.75 
 
 
304 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  41.75 
 
 
304 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  37.41 
 
 
306 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  38.73 
 
 
302 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  41.4 
 
 
304 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  39.58 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  38.44 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  37.12 
 
 
324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  37.5 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  36.45 
 
 
329 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  35.43 
 
 
320 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  40.41 
 
 
311 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  39.04 
 
 
338 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.45 
 
 
334 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  41.2 
 
 
306 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  36.14 
 
 
312 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  37.33 
 
 
311 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  40.49 
 
 
307 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  39.79 
 
 
302 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.02 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.11 
 
 
287 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  36.24 
 
 
336 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  35.4 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  34.69 
 
 
305 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.77 
 
 
289 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  35.19 
 
 
290 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  34.77 
 
 
289 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  34.04 
 
 
290 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  36.84 
 
 
282 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  34.82 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.49 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.84 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  36.43 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  34.74 
 
 
282 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  34.15 
 
 
285 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  34.5 
 
 
302 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.98 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  35.42 
 
 
290 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.95 
 
 
290 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.94 
 
 
289 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.42 
 
 
282 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.49 
 
 
290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.42 
 
 
282 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  34.35 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.39 
 
 
285 aa  135  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  34.04 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  34.04 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  34.97 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  33.33 
 
 
282 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  30.74 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  35.31 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  35.09 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.93 
 
 
285 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.98 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.17 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.17 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.57 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  33.68 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  35.89 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  35.05 
 
 
302 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  34.38 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  31.49 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  32.66 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.27 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.11 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  33.33 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  34.97 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.11 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  35.79 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.11 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.99 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  35.29 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  34.51 
 
 
289 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.76 
 
 
918 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  32.98 
 
 
281 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  32.91 
 
 
302 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  34.39 
 
 
285 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  31.69 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  33.9 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  30.84 
 
 
326 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  33.21 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>