46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0235 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3137  hypothetical protein  39.34 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1194  Protein of unknown function DUF2141  38.03 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1620  hypothetical protein  37.4 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1202  hypothetical protein  29.71 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0422688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2584  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4023  hypothetical protein  32.74 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.792226 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1469  hypothetical protein  34.96 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4785  hypothetical protein  32.81 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.719029  normal  0.162174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1297  hypothetical protein  32.09 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1087  hypothetical protein  32.19 
 
 		 157 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1117  hypothetical protein  32.52 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688301  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3923  hypothetical protein  31.71 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5428  hypothetical protein  47.76 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3527  hypothetical protein  30.61 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05215  hypothetical protein  36.07 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0350  hypothetical protein  26.4 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0357  hypothetical protein  26.4 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.516954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1327  hypothetical protein  31.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4915  hypothetical protein  31.03 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.226348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1042  hypothetical protein  26.73 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0670171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0342  Protein of unknown function DUF2141  28.35 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1319  hypothetical protein  29.86 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.271113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2599  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0103  hypothetical protein  30.58 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1896  hypothetical protein  30.09 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000720474  hitchhiker  0.000884607 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3918  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3067  hypothetical protein  26.43 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0110363  hitchhiker  0.00000000675932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1287  hypothetical protein  25.19 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0738123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5466  Protein of unknown function DUF2141  29.31 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1321  hypothetical protein  25.6 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.239376  hitchhiker  0.00361617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1595  hypothetical protein  27.52 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1243  hypothetical protein  25.19 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1550  hypothetical protein  33.01 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000569387  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2825  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3749  hypothetical protein  33.86 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.642558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3440  hypothetical protein  36.19 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  0.118261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5198  hypothetical protein  31.86 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08966  hypothetical protein  28.21 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3636  hypothetical protein  30.23 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.0373236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3053  hypothetical protein  33.87 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>