More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0199 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 		 403 aa  810    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  73.51 
 
 		 404 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.15 
 
 		 414 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.04 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.69 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.29 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.55 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.23 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  52.11 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.04 
 
 		 429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.16 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.92 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.23 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.92 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.13 
 
 		 408 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.21 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  50.13 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.39 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.14 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.51 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  48.32 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  49.08 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.52 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.29 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.68 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.84 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  48.82 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  47.03 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  44.56 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.78 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.51 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  47.67 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  48.29 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  48.2 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.82 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.55 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.29 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.29 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.29 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.63 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.29 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.7 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.46 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.29 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  47.63 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.29 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  49.08 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.84 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.15 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  44.87 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.19 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.03 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.77 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.03 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.51 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.89 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.77 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.24 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.45 
 
 		 419 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.51 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.24 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.55 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  47.24 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.59 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.24 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.98 
 
 		 406 aa  364  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 403 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  47.24 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.08 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  45.52 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.25 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  44.8 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  44.8 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.03 
 
 		 413 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  44.3 
 
 		 412 aa  363  4e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.77 
 
 		 406 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.72 
 
 		 406 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  45.98 
 
 		 421 aa  362  6e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  44.8 
 
 		 406 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.98 
 
 		 406 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.63 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.58 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.3 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  44.8 
 
 		 406 aa  362  9e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  44.8 
 
 		 406 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.43 
 
 		 420 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.95 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.52 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.24 
 
 		 413 aa  361  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.55 
 
 		 406 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>