More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0193 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 349 aa  689    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.86 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.01 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  54.7 
 
 		 348 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.43 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.74 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.74 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.02 
 
 		 364 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.59 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.29 
 
 		 363 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.72 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.01 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.92 
 
 		 362 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.57 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.59 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.99 
 
 		 367 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.72 
 
 		 358 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.57 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.74 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.15 
 
 		 358 aa  315  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.65 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.6 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.71 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.13 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.86 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  52.27 
 
 		 374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.31 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 		 352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.63 
 
 		 357 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.97 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.84 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 352 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 362 aa  289  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.9 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  46.36 
 
 		 349 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.34 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  48.29 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  45.83 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  46.86 
 
 		 377 aa  276  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  44.32 
 
 		 384 aa  275  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.88 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  47.59 
 
 		 396 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.26 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  45.15 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  45.8 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  43.77 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.32 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.6 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  44.38 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.99 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.07 
 
 		 356 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  43.67 
 
 		 375 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.96 
 
 		 348 aa  268  8.999999999999999e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  45.03 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  44.79 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.7 
 
 		 351 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.27 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  45.32 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  43.32 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.42 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.29 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.32 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2150  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.26 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  39 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 347 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  42.98 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  43.31 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  43.53 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 		 360 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  43.13 
 
 		 356 aa  262  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  43.36 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2465  dihydroorotate dehydrogenase 2  47 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.282776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2205  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.9 
 
 		 357 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.28 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.28 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.07 
 
 		 361 aa  258  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>